Ученые Центрального университета, сообщает его пресс- служба, предложили вычислительный метод, способный за считанные часы находить гены, которые используют для своего роста клетки рака толстой кишки.
Исследование опубликовано в Международном журнале молекулярных наук (International Journal of Molecular Sciences). Оно может стать важным шагом к созданию более эффективных лекарств от колоректального рака.
Несмотря на прогресс в ранней диагностике и лечении, проблема устойчивости опухолей к терапии остается острой: многие пациенты перестают реагировать на известные препараты, что заставляет искать новые, более точные мишени для лекарств. Одной из таких мишеней может стать особая молекула — длинная некодирующая РНК под названием SNHG1, уровень которой связан с активностью генов, важных для роста опухоли. Но до сих пор установить, на какие именно участки генома она влияет, было чрезвычайно сложно.
Российские исследователи предложили алгоритм, который помогает быстро находить новые перспективные участки генома, связаные с опухолеобразованием и пригодные для дальнейшей экспериментальной проверки в качестве потенциальных мишеней для терапии.
«Раньше биологам приходилось долго, методом проб и ошибок выяснять, какие гены может активировать та или иная длинная некодирующая РНК через суперэнхансеры. Мы предложили подход, который за несколько часов вычислений дает проверяемую гипотезу — короткий список приоритетных генов-мишеней. Это как навигатор в лабиринте генома: вместо того чтобы блуждать, исследователи и врачи-онкологи сразу видят потенциальные направления терапии. По сути, мы составили дорожную карту для экспериментальных лабораторий, которые теперь могут целенаправленно проверять, замедляет ли подавление исследованной длинной некодирующей РНК — SNHG1 — рост опухоли. Особенно важно, что методология анализа применима не только к колоректальному, но и к другим типам опухолей, и мы надеемся, что со временем такие подходы помогут создавать более точные, персонализированные методы лечения для миллионов пациентов», - прокомментировал научный сотрудник лаборатории вычислительной биомедицины и молекулярной диагностики в Центральном университете Герман Ашниев.
P.S. По данным Всемирной организации здравоохранения, ежегодно в мире выявляется более 1,9 млн новых случаев рака толстой и прямой кишки, а число смертей превышает 900 тысяч — это второе место среди онкологических причин смертности.
